Novogene / フィルジェン ID: J00606

微生物ゲノムアンプリコン 受託解析サービス ID: J00606

サービスについて

概要

細菌の16S、真菌の18SおよびITS(internal transcribed spacer)を指標とした解析を行います。複数設計されたプライマーセットよりご希望のプライマーセットを選択して頂けます。また、ご自身で設計したプライマーセットでの解析にも対応しています。

サービス内容

  • ワークフロー(fig.1
  • プライマーデザイン(fig.2
  • データ解析パイプライン(fig.3
  • Library Construction(fig.4
  • 標準データ解析例(fig.5
    微生物ゲノムアンプリコンデータ解析サービスは、実験手順、シークエンスデータのクオリティー情報、菌種組成、系統図、α多様性、およびβ多様性などについてまとめています。

  • 必要サンプル量

    • ゲノムDNA:150ng以上(300ng以上を強く推奨)
    • 容量:20μL以上
    • 濃度:5ng/μL以上
    • O.D.260/280:1.8~2.0
    • Buffer:TE BufferまたはddH2O
    1. 電気泳動を実施し、泳動写真を添付してください。
      * 電気泳動は、次の条件で実施してください。 1.0% agarose gel; 1.0% TAE solution; 100V for 40 min.
    2. RNase処理を行い、DNAが分解されていないことを確認してください。
    3. DNase、RNaseフリーの1.5mLまたは2mLのチューブを使用してください。(スクリューキャップ式を推奨します。)
    4. ゲノムDNAは、凍結融解をできる限り避け、4℃でTE bufferまたはddH2Oにて保存してください。
      * 長期保存の場合は、-20℃または-80℃で保存してください。
    5. UVスペクトルベースの濃度測定法では、RNA、dsDNA、ssDNA、フリーの核酸等も同時に検出するため、ゲノムDNAの濃度測定が不正確になる場合がありますので、蛍光ベースの定量法でも確認して頂くことを強く推奨します。
      * UVスペクトルベースで測定した場合、上記よりも多いゲノムDNAを準備してください。
    6. サンプル送付先及び注意事項につきましては、「受託解析サービスの流れ」をご参照ください。

    ご注文に関して

    お問い合わせフォーム よりお問い合わせください。

    参考価格・納期

    サービス内容 数量 価格(税抜) Cat.#
    微生物ゲノムアンプリコン
    受託解析サービス(60,000 reads)
    バイオインフォマティクス解析付
    5-9サンプル お問合せ F-Novo-AS3-(サンプル数)
    10-24サンプル お問合せ
    25-49サンプル お問合せ
    50-99サンプル お問合せ
    微生物ゲノムアンプリコン
    受託解析サービス(100,000 reads)
    バイオインフォマティクス解析付
    5-9サンプル お問合せ F-Novo-AS5-(サンプル数)
    10-24サンプル お問合せ
    25-49サンプル お問合せ
    50-99サンプル お問合せ<

    * 海外へのサンプル輸送費用およびハードディスク費用が別途必要です。

    関連サイト