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全ゲノムシーケンス・データ解析サービス ID: J01646

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シーケンスは低価格に、多様なバイオインフォマティクスニーズにもお応えします

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カテゴリ

サービスについて

概要

『WGS（Whole Genome Sequencing）』では、全ゲノム領域を対象として塩基配列を取得します。様々なタイプのバリアント解析や、ロングリードシーケンスデータと合わせて新規ゲノム配列の確立が可能です。

特長

丁寧なビフォア・アフターサポート
15名以上のPh.D.が在籍しており、技術サポート体制に力を入れています。
リーズナブルで高品質なシーケンス
複数の国内外シーケンスプロバイダーと提携し、低価格・高品質を実現します。
目的に応じたカスタムメイド解析
基本解析からオーダーメイドの高次解析・統合解析まで幅広く対応します。
付帯費用ナシ
データ転送費などの付帯費用は全てサービス価格に含まれています。

サービスプラン

生データプラン
シーケンスにより取得したfastqデータ（生データ）のみを納品するプランです。

ベーシック解析プラン
基本解析を実施するプランです。種々の描画により、個別サンプル間のばらつきをスピーディに俯瞰頂けます。

スタンダード解析プラン
ベーシックプランの解析内容に加え、ご希望の解析をオプションでお選びいただき実施するプランです。

オーダーメイド解析プラン
ご研究目的やご要望の図版、参考文献等に応じて、標準サービスメニュー外のカスタム解析を実施します。解析目的・内容の擦り合わせのため、原則としてご依頼前に当社研究員とのWebミーティングが必要です。
＊オーダーメイド解析プランについてはプロジェクトの混雑状況によりお受けできない場合があります。ご了承ください。

スタンダード解析例

群特異的SNP/Indelリストの作成
群特異的SNP/Indelリストの作成では、2群以上において各群で共通する、または群特異的なSNP/Indelを検出し、各SNP/Indelに対してアノテーション（DBSNP、アミノ酸配列変化等）を付与しリストを作成します。
SV解析
SV解析では、Structural Variation解析を実施します。Normalサンプルをコントロールとし、Tumorサンプルにおける重複（Duplication）、欠失（Deletion）、逆位（Inversion）、挿入（Insertion）、BND（Breakend）の推定を実施します。また、フィルタリングしてPASSが記載されたSV領域にアノテーションを付与します。
CNV解析
CNV解析では、コピー数多型を検出し、特定のサンプル間での差異を評価することができます。コピー数の変動を特定のアルゴリズムを使用して検出します。

解析例（fig.1）（fig.2）

fig.1 変異の絞り込み

fig.2 CNV解析

サービスの流れ（fig.3）

fig.3 サービスの流れ

ご注文に関して

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参考価格・納期

サービス項目	プラン	リード長	データ量リード数	価格（税抜）	納期
WGS （PCRフリー）	生データプラン	150×2 paired-end （PE150）	90 Gb 600.0M reads	￥120,000	サンプル受領から4～7週
WGS 細菌･真菌（PCRフリー）	生データプラン	150×2 paired-end （PE150）	1 Gb 6.7M reads	￥30,000	サンプル受領から4～7週
WGS データ量指定（PCRフリー）	生データプラン	150×2 paired-end （PE150）	お客様指定	お問い合わせ	サンプル受領から4～7週
WGS	ベーシック解析プラン	-	-	お問い合わせ	お問い合わせ

オプションでDNA抽出（別途料金）から承ることもできます。
データ量はお客様のご希望に応じて変更できますので、お問い合わせください。
納期はレリクサ社がサンプルをお預かりした日から起算した週数です。
バイオインフォマティクス解析のみでも承っておりますので、お問い合わせください。

受託オンラインCommissioned Research Online和研薬株式会社 和研薬株式会社