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ZYMO RESEARCH / フナコシ ID: J02047

RNA-Seq Analytical Service ID: J02047

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RNAシークエンシング解析受託サービス

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サービスについて

概要

生物学的試料において差次的に発現する遺伝子を明らかにし、差次的発現遺伝子に関連する機能やパスウェイを解明する受託解析サービスです。

用途の一例
・疾患メカニズムの評価
・差次的遺伝子発現解析
・miRNAバイオマーカーの発見
・薬物スクリーニングと有効性評価
・農業バイオ技術の効率性の研究と改善

特長

【Total RNAシークエンシングサービス】
・少量の試料、FFPE試料、あらゆる生物（哺乳類、植物、細菌など）に対応
・検証済みの手法により偏りのない遺伝子発現プロファイリングを実現
・論文化に対応した包括的なバイオインフォマティクス遺伝子発現解析報告書をご提供

【micro RNAシークエンシングサービス】
・効率的なマイクロRNAの捕捉と分離
・血漿および血清試料からのcfRNAと互換性あり
・論文化に対応した包括的なバイオインフォマティクス遺伝子発現解析報告書をご提供

サービス内容

QCデータおよび基本的なシークエンシング結果をご提供するBasic Serviceと、それらにバイオインフォマティクス解析を加えたFull Serviceからご選択いただけます。
＊ RNA抽出はサービスパッケージには含まれていません。
サービス項目 Total RNA-Seq
Service Package		 microRNA-Seq
Service Package		 3’mRNA-Seq
Service Package
Basic Service Full Service Basic Service Full Service Basic Service Full Service
サービスコード Q1400 Q1404 Q1401 Q1405 Q1402 Q1406
RNAのQCと試料の正規化 ● ● ● ● ● ●
ライブラリーの調製とQC ● ● ● ● ● ●
シークエンスデータの作成 ●（＊1） ●（＊1） ● ● ●（＊1） ●（＊1）
FASTQファイルの提供 ● ー ● ー ● ー
シークエンスデータの品質評価 ー ●（＊2） ー ●（＊3） ー ●（＊2）
距離 / 類似性解析 ー ● ー ● ー ●
遺伝子（mRNA）発現差：
発現差のある遺伝子のリストと多重検定補正による有意性検定		 ー ● ー ● ー ●
遺伝子セットのエンリッチメント解析 ー ● ー ー ー ●
クラスタリング解析 試料ごとの解析 ー ● ー ー ー ●
ヒートマップ解析 ー ー ー ● ー ー

＊1 1試料当たり約30,000,000 read pair。
＊2 統計分析、fastQC、STAR、RSeQC、ライブラリー構成バイオタイプ、featureCountsを含む。
＊3 統計分析、fastQC、miRTraceを含む。

【標準的QCにおけるRNA抽出（オプション、サービスコード#Q1008）】
・RNAの抽出
・Nano-dropまたはQubitを用いた定量 / 品質評価
・Tapestationを用いた定性評価

RNA-Seqの技術情報（Total RNAの場合）

シークエンシングプラットフォーム NovaSeq 6000またはNovaSeq X
測定範囲 2x150 bp、Unique Dual Inedxing（UDI）
シークエンシング深度 約30,000,000 read pair（カスタマイズ可）
適応可能な試料の種類 RNA、細胞、組織、FFPE組織
ライブラリー作製に使用するキット Zymo-Seq RiboFree Total RNA Library Kit（#R3000）
rRNAの除去 あらゆる生物に対応した酵素法によるrRNAの除去
データの可視化
  • サンプル類似性マトリックス
  • MDSプロット
  • 上位遺伝子発現パターンのヒートマップ
  • 散布図
  • MAプロット
統計分析
  • DESeq2パッケージによる遺伝子発現差解析
  • 遺伝子セットエンリッチメント解析（パスウェイアノテーションが利用可能な場合）

結果報告書（Full Serviceの場合）

結果報告書（Full Serviceの場合）には、以下の内容が含まれます。
結果報告書例についてはこちらをご覧下さい。
  • サンプル距離マトリックス（PCA / ヒートマップ）
  • 遺伝子発現差
  • 散布図
  • MAプロット
  • 遺伝子セットエンリッチメント解析

ご注文に関して

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参考価格・納期

サービス項目 価格（税抜） 納期
RNA-Seq Analytical Service お問い合わせ お問い合わせ

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  • ※価格及び、サービスの仕様・内容などにつきまして、予告なしに変更されることがあります。
  • ※表示している参考価格は消費税等は含まれておりません。
  • ※受託サービスは、すべて研究目的として作業を行います。その他の目的（医療品・食品の製造・品質管理や医療診断など）には使用しないで下さい。
  • ※納期は参考納期です。諸事情により、前後する場合がございます。納期の詳細については個別にお問い合わせください。
  • ※会社名・サービス名などは、各社の商標・登録商標です。
  • ※納品物によっては、その構成物（例えば、ベクター、蛍光色素など）の使用に制限がある場合があります。
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  • ※人間への感染性が疑われるサンプルに関しては、お受けできない可能性がございます。
  • ※サンプルの保管および返却を行っていない場合があります。お客様より提供いただいたサンプルおよび解析データ等は、業務終了後、廃棄される場合がございます。

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