サービスについて

概要

次世代シーケンサー(NGS)を使用した変異解析や発現解析などの各種受託解析を承っております。
解析用途に合わせたライブラリー調製の工程のみの受託や、ご自身で調製されたライブラリーをお預かりしてシーケンスのみの受託も対応しております。
NGSを用いた解析を日々行っている皆様から、これからNGSの利用を考えている皆様まで、幅広くご利用いただけるサービスをご用意いたしました。
本受託サービスは、NGSを用いたゲノム解析で数多くの成果を上げているかずさDNA研究所の協力のもとで提供しております。

NGS受託解析の強み
  • 国内で受託解析を実施しているため、海外での解析サービスと比較して安心かつ納期が早い。
  • 専門の研究者によるコンサルティングとアフターフォロー。
使用機器
  • NextSeq 500, MiSeq(illumina社)
  • DNBSEQ-G400RS、DNBSEQ-T1+(MGI社)
  • AVITI24 (Element Biosciences社)

解析メニュー

サンプルは1個から承ります。
サンプル量および品質が下記リスト記載の量に満たない場合でも、解析可能な場合がございます。予めご相談ください。

* 取得データ量は目安の数値であり、それらのデータ量を保証するものではありません。

ゲノム解析
解析メニュー 取得データ目安 必要サンプル量 納期
全ゲノムシークエンス ご依頼内容ごとに設定 DNA:2μg以上
(100ng/μL以上)
4週間〜
Human Exome-Seq
(150bp Paired-End)
アジレントV6 or V7
4,000万リード、6Gb DNA:2μg以上
(100ng/μL以上)
8週間

● 作業内容:ライブラリ調製+シーケンサーラン
●品質確認はオプションとなります。


発現解析
解析メニュー 取得データ目安 必要サンプル量 納期
真核生物 mRNA-Seq
(TypeA; 75bp Single-Read)
1,500万リード、1125Mb total RNA:2μg以上
(40ng/μL以上)
4週間
真核生物 mRNA-Seq
(TyepB;75bp Paired-End)
3,000万リード、2.25Gb total RNA:2μg以上
(40ng/μL以上)
8週間
miRNA-Seq
(75bp Single-Read)
1,500万リード、1125Mb total RNA:4μg以上
(200ng/μL以上)
8週間
3’RNA-Seq 100万リード total RNA:2μg以上
(40ng/μL 以上)
8週間
シングルセル3’RNA Seq 100万リード シングルセル 8週間

● 作業内容:クオリティチェック+ライブラリ調製+シーケンサーラン
●RNA品質検査費用を価格に含みます。ユーロフィンジェノミクス推奨基準を満たさない場合、解析中止、もしくはサンプルの再提出をお願いすることがございます。品質検査は2回目までは無償で、3回目以降は有償となります。


エピジェネティクス関連
解析メニュー 取得データ目安 必要サンプル量 納期
Human Bisulfite-Seq
(75bp Paired-End)
3,000万リード、2.25Gb DNA:4μg以上
(100ng/μL以上)
8週間
ChIP-Seq
(75bp Single-Read)
ご依頼内容ごとに設定 クロマチン免疫沈降後DNA:
100ng以上(10ng/μL以上)
お問い合わせ

● 品質確認はオプションとなります。


ライブラリ調製
解析メニュー 必要サンプル量 納期
mRNA-Seq用 total RNA:2μg以上(40ng/μL以上) 3週間
Total RNA-Seq用 total RNA:2μg以上(40ng/μL以上) 3週間
Human Exome-Seq用 DNA:2μg以上(100ng/μL以上) 3週間
全ゲノム、Target-Seq用 DNA:2μg以上(100ng/μL以上) 3週間

*納品物は作製済みのライブラリーとなります。
●作業内容:材料RNAのクオリティチェック、ライブラリ調製、調製したライブラリのクオリティーチェック(長さ、濃度)
●RNA品質検査の結果、推奨基準を満たさない場合、作業中止、もしくはサンプルの再提出をお願いすることがございます。
●qPCRによるライブラリの定量はオプション(有料)です。

シーケンサーラン(レーン貸切)
解析メニュー 取得データ目安 納期
NextSeq 75bp Single-Read:4億リード、最大30Gb 4週間
75bp Paired-End Mid:2.6億リード、最大 19.5Gb
150bp Paired-End Mid:2.6億リード、最大39Gb
75bp Paired-End:8億リード、最大60Gb
150bp Paired-End:8億リード、最大120Gb
MiSeq 150bp Paired-End:2,700万リード、4Gb 4週間
250bp Paired-End:2,700万リード、6.7Gb
300bp Paired-End:4,700万リード、14.1Gb
150bp Paired-End Nano:200万リード、300Mb
250bp Paired-End Nano:200万リード、500Mb
DNBSEQ-G400RS 50bp Single-Read:16億リード、80Gb 8週間
100bp Single-Read:16億リード、160Gb
400bp Single-Read:16億リード、640Gb
100bp Paired-End:32億リード、320Gb
150bp Paired-End:32億リード、480Gb
200bp Paired-End:32億リード、640Gb
イルミナライブラリConversion費用
(Conversionを実施、ランは含みません)
1週間

●作業内容:シーケンサーラン
●品質確認はオプションとなります。
●MGI社 DNBSEQ-T1+、Element Biosciences社 AVITI24でのランも承ります。ご希望の方はお問い合わせください。


ライブラリのクオリティチェック
解析メニュー 納期
クオリティチェック(バイオアナライザー) 1週間
濃度測定(定量PCR) 1週間

抗体可変領域解析
解析メニュー 納期
基本解析 3~4週間
CDR同定 1~2週間

5’-RACE法により5’UTRから定常領域までの塩基配列を取得し、シグナル配列部分の開始メチオニンから可変領域の末端部分までの配列を報告します。かずさDNA研究所では大規模cDNAプロジェクトでの経験を生かし、抗体産生細胞からRNA抽出を行い、迅速な可変領域配列の決定を行います。


納品物

HDDまたはDVD-Rに収納して納品
  • Fastqファイル
  • 作業報告書

ご注文に関して

お問い合わせフォーム よりお問い合わせください。

参考価格・納期

サービス項目 価格(税抜) 納期
NGS解析 お問い合わせ 上記をご確認ください

関連サイト