概要
エクソソームの単離及びナノサイトの解析に加えて、NGS解析までをまとめたパックです。
ご提供いただいたサンプルからエクソソーム単離及びナノサイト解析を富士フイルム和光純薬にて実施します。ナノサイトで確認後、単離したエクソソームをNGS実施元に和光純薬からお送りします。NGS実施元にてRNA抽出及びQC後、NGS解析を実施します。
既知のmiRNAに加え、新規のmiRNAまで解析対象という方などにおすすめのサービスです。
＊生体試料サンプルについては弊社でもご準備が可能です（
生体試料調達サービス）。
細胞の培養からについても実施できますので、ご相談ください。
エクソソームRNA抽出からmicroRNAの検出までの流れ（fig.2）
RNA抽出からデータ解析までの仕様
【エクソソームRNA抽出】
エクソソーム・セルフリーRNAに対応したRNA抽出キットにより精製。
【ライブラリ調製】
5′ P/3′ OHを末端にもつ成熟microRNAを対象にしたライブラリ調製を実施。
トータルRNA 1 ngからライブラリ調製可能なキットにより微量RNAにも対応。
【シークエンシング】
Illumina NovaSeq サンプルあたり標準1,000万ペア
エンドリード（2x150 bp換算でデータ量3 Gb）
【データ解析】
- リファレンス配列へのマッピング
- アノテーション済みmicroRNAのカウント
- 新規microRNAの探索
- サンプル間でのmicroRNA発現量比較
- 発現変動microRNAの標的予測とオントロジー解析
＊解析内容は変更になる可能性がございます。ご依頼時にご確認ください。
