概要
VectorBuilderでは、RNAi実験に対応した様々なshRNA関連ツールをご提供しています。U6およびmiR30ベースの両システムをご用意していますので、実験のニーズに合わせて自由にカスタマイズいただくことにより、フレキシブルにshRNA発現を制御することができます。ウイルスパッケージングサービス（レンチウイルス、AAV、アデノウイルスなど）もご提供しておりますので、トランスフェクションが難しい細胞には、ウイルスを使用してshRNAツールを導入することも可能です。また大規模な機能喪失スクリーニングには、プール型shRNAライブラリーの構築サービスもご用意しています。よく使われるモデル生物のshRNAデータベースとオンラインベクターデザインプラットフォームを使用すれば、目的遺伝子（GOI）に最適なshRNAを簡単に見つけ、ベクターデザインができます。
特長
- 全ゲノムshRNAデータベースが、ベクタービルダーオンラインのベクターデザインポータルに統合されているため、ベクターデザインとshRNAの選択が簡単に行える。
- ベクターバックボーンとベクターコンポーネントの豊富なコレクション。
- 既製品shRNAライブラリーとカスタムメイドshRNAライブラリーに対応。
- 100%シークエンス保証。他社が追随できないお得価格と早い作業日数で受託サービスをお届け。
- shRNAの選択やベクターデザイン、トラブルシューティングなどきめ細やかな技術サポート をご提供。
shRNA受託サービスの種類
【カスタムshRNAベクター】
直観的に使えるオンラインデザインプラットフォームには、30種類以上のベクターバックボーン（非ウイルス用、ウイルス用、トランスポゾン用）と、無制限の組みあわせが可能なベクターコンポーネント（プロモーター、蛍光マーカー、薬剤耐性マーカーなど）が自由自在に選択できるようになっているため、希望通りのベクターデザインにカスタマイズすることができます。ベクタービルダーでは、shRNA データベースがベクターデザインポータルに直結しているため、目的遺伝子に対して、最適なshRNAを簡単に選択することができます。ノックダウン効率のテストには、 shRNAセンサーベクターもご用意していますのでお試しください。
プラスミドDNA精製や、ウイルスパッケージングは関連サービスとして、ベクター構築サービスに追加して同時注文を行っていただけます。
【ポピュラーshRNAベクター】
VectorBuilderでは、コントロールベクターとしてスクランブルshRNAや、盛んに研究されているポピュラー遺伝子をターゲットとしたshRNAベクターをご用意しています。すでにデザインされているベクターをショッピングカートに追加していただければご注文も簡単です。プラスミドDNA精製や、ウイルスパッケージングは関連サービスとして、ベクター構築サービスに追加して同時注文を行っていただけます。
【shRNAウイルス】
VectorBuilderでは、ウイルスパッケージングサービス（レンチウイルス、AAV、アデノウイルスなど）もベクター構築に合わせてご提供しています。トランスフェクションが難しい細胞には、ウイルスを使用して目的shRNAのツールを導入することも可能です。パッケージングサイズは、目的に合わせて様々なサイズからお選びいただくことができます。パッケージングはベクタービルダー独自の技術・試薬で改良されたオリジナルプロトコールで、当社のウイルスベクターシステムに最適化されています。タイター、純度、導入効率、再現性に優れているため、リピーターも多く、満足度の高い弊社サービスの一つとなっています。
【shRNA (3+1)ウイルスパッケージング】
ノックダウン効率はshRNAの長さ、ループ構造、shRNAのGC含量および熱力学的安定性、標的配列の二次構造、さらに他の遺伝子とのオフターゲットマッチなど、複数の様々な要因によって決まってきます。そのためアルゴリズムに基づいてデザインされた高いスコアーのshRNAを使ったとしても、強いノックダウン効果が得られない場合もあります。通常～50-70%のshRNAにはある程度のノックダウン効果が観察されますが、強力なノックダウン効果が観察されるのは、そのうちの～20-30%です。この問題を克服するために、複数のshRNAをテストし、最適なshRNAを使うことが結果への近道です。
VectorBuilderでは shRNA (3+1) ウイルスパッケージングサービスをご提供しています。このサービスでは、目的遺伝子をターゲットする3種類のカスタムshRNAベクターのウイルスパッケージングと、1種類のスクランブルコントロールshRNAレンチウイルスのパッケージングをセットにして、割引価格でご提供しています。このサービスは現在、レンチウイルス、AAV、アデノウイルスパッケージングに対応しています。
【shRNAライプラリー（プール型）】
カスタムライブラリー：疾患機序、薬物治療に対する細胞応答、発生プロセス、遺伝子制御などに関与する遺伝子の大規模な機能欠失（loss-of-function）スクリーニングを行うために、強力かつコストパフォーマンスの高いツールです。ライブラリーは、大腸菌ストック、プラスミドDNAプール、パッケー人ぐ済のレンチウイルスなど、ユーザーのご希望に合わせた形態に対応します。カスタムライブラリーは、次世代シークエンシングで完全に検証後、シークエンス情報とともにお届けします。
既製品プリメイドshRNAライブラリー：ヒトまたはマウスの全ゲノム（～19,000 RefSeq genes）またはエリート遺伝子（PubMed Centralで、引用数の高い上位～2,000遺伝子）があり、eady-to-useの高タイターのレンチウイルスで納品します。各遺伝子は5～6種の異なるshRNAでターゲットされています。ライブラリーの品質は次世代シークエンシング（NGS）と機能アッセイで完全に検証後出荷いたします。
既製品shRNAライブラリーの特長：
・全ゲノムへのターゲッティング、かつ高いカバー率のターゲッティング
・NGSによるライブラリー品質の検証
・高い均質性
・ready-to-useの高タイターのレンチウイルス
・EGFP/Puroの両マーカーを発現させるウイルスのため、導入された細胞の選別が目的に合わせて効果的に行える
【shRNAノックダウン安定発現細胞株】
VectorBuilderでは、GOIの長期ノックダウンが必要なアプリケーション向けに、shRNA安定細胞株樹立サービスをご提供しています。ノックダウンスコアの上位3位のshRNA候補ターゲットシークエンスをテストし、ノックダウン効率が最も高かったshRNAをレンチウイルスで細胞に導入して安定細胞株を作製します。細胞株のノックダウンレベルはRT-qPCRで検証します。単離された細胞株は、無菌試験やマイコプラズマ検出など一連の標準的なQCアッセイに合格して出荷されます。
