ユーロフィンジェノミクス / ユーロフィンジェノミクス ID: J02301

プロテオーム解析 ID: J02301

サービスについて

概要

従来のプロテオーム解析は分析深度が低く、3,000~5,000種類のタンパク質しか観測することができませんでした。これでは様々な分野で着目されることの多いキナーゼや転写因子などの微量タンパク質を観測するには不十分であり、さらなる分析深度の拡大が期待され続けてきました。本受託サービスの解析を担うかずさDNA研究所では分析深度、定量性に優れたDIAプロテオミクス技術を独自に最適化し、さらに最新鋭の質量分析計で測定することにより、哺乳類培養細胞から最大12,000種類のタンパク質を同定・比較定量を行えるシステムを構築しました。本サービスではこの最新鋭のシステムを用いた世界最高峰のプロテオーム解析を提供いたします。

プロテオーム受託解析の強み

  • 国内で受託解析を実施しているため、海外での解析サービスと比較して安心かつ納期が早い。
  • 世界最高峰のプロテオーム解析を提供します。
  • 多種多様なサンプルのプロテオーム解析実績を持つ研究者が解析します。
  • 専門の研究者によるコンサルティングとアフターフォロー。

使用機器

Orbitrap Exprolis 480, Orbitrap Astral (Thermo Fisher Scientific社), timsTOF HT (Bruker社)
*本サービスはタンパク質配列が解析されている生物種を対象としたものです。

特長

  • 分析深度
    MS1で検出されたペプチドピークを選択してMS2解析を行うのではなく、MS1の全m/zレンジを細かく区切りながら連続的にMS2を取得します。これによって、ピーク強度の低いペプチドを含めてMS1で観測されたすべてのペプチドピークに対してMS2を取得できるため、微量タンパク質・ペプチドの検出が可能で分析深度の高い測定が可能です。
  • 定量性
    定量解析では実際にペプチドの同定に使われたMS2ピークを用いて定量値を算出するため、DDAプロテオーム解析のように分子量が類似するペプチドが同じ溶出時間に検出されても区別することが可能であり、ピークの取り間違えが起きづらく、正確な定量値を導き出すことができます。

解析メニュー

* 取得データ量は目安の数値であり、それらのデータ量を保証するものではありません。

DIAによる高深度発現プロテオーム解析 (凍結細胞・組織や特殊な濃縮を必要としない試料は本メニューで対応)
メニュー 取得データ目安
ディープ / ウルトラディープ
必要サンプル量 納期(営業日) サンプル数 価格 / 1サンプル(税抜)
ディープ / ウルトラディープ
備考
ディープDIAプロテオーム解析
Orbitrap Exploris 480
~9,000
タンパク質
タンパク質量:10ug以上
目安: 細胞 1x10^5以上,
組織 0.1mg以上
20 1~5 ¥62,700 6検体以上は要相談
ウルトラディープDIAプロテオーム解析
Orbitrap Astral
~12,000
タンパク質
タンパク質量:10ug以上
目安: 細胞 1x10^5以上,
組織 0.1mg以上
20 1~5 ¥144,200 6検体以上は要相談
血漿 / 血清 他 低侵襲検体を対象とするプロテオーム解析(髄液や細胞外小胞などの低タンパク濃度検体は「DIAによる高深度発現プロテオーム解析」で対応)
メニュー 取得データ目安
ディープ / ウルトラディープ
必要サンプル量 納期(営業日) サンプル数 価格 / 1サンプル(税抜)
ディープ / ウルトラディープ
備考
TomAP-MSによる血清 / 血漿プロテオーム解析
(多検体分析のニーズに対応するため、本メニューのディープのみショートグラジエントのAstralによる分析を実施)
血漿~6,000 / ~8,000
血清~5,000 / ~7,000
タンパク質
血清100uL(それ以下でも対応可能)
血漿50uL(それ以下でも対応可能)
20 1~5 ¥72,900 / ¥154,400 6検体以上は要相談
Seerによる血清 / 血漿プロテオーム解析 血清 / 血漿 250uL(それ以下でも対応可能) 要相談
高存在量タンパク質除去による血清 / 血漿プロテオーム解析
(ヒト:Top14除去、マウス、ラット:albumin / IgG除去、その他:albumin除去)
~1,500 / ~3,000 タンパク質 血清 / 血漿10uL以上 20 1~5 ¥91,900 / ¥173,400 6検体以上は要相談
乾燥ろ紙血からのDIAプロテオーム解析(独自のNANDA法処理により高深度な解析が可能) ~3,000 / ~7,000 タンパク質 DBS 直径1.2cm程度の ディスク1枚分以上 25 1~5 ¥84,600 / ¥166,100 6検体以上は要相談
テープストリッピングサンプルからのDIAプロテオーム解析 350mm2以上の面積 直径22mmのテープを使用 25 1~5 ¥84,600 / ¥166,100 6検体以上は要相談
DIAによるゲル中タンパク質の高感度同定解析
メニュー 取得データ目安 必要サンプル量 納期 (営業日) サンプル数 カタログ価格(税別) 備考
ゲル内タンパク質同定(4DプロテオミクスによるDDA解析)
timsTOF HT
銀染色・蛍光染色検出レベル以上 20 1~5 ¥33,500 6検体以上は要相談
DIAによるアフィニティ精製試料中のタンパク同定と相対定量解析(AP-MS)
AP:アフィニティ精製→免疫沈降、プルダウン、ビオチンアフィニティー精製など
メニュー 取得データ目安 必要サンプル量 納期 (営業日) サンプル数 カタログ価格(税別)
ディープ / ウルトラディープ
備考
AP-MS解析 (提出サンプル:ビーズ)*推奨プロトコル ー組換えタグ付きタンパク質や特異抗体に対するターゲットタンパク質及びそのインタラクター解析ー 2〜3 μgの抗体で免疫沈降したタンパク質 20 1~5 ¥70,000 / ¥151,500 6検体以上は要相談
AP-MS解析(提出サンプル:アフィニティー精製処理した溶出物) ー組換えタグ付きタンパク質や特異抗体に対するターゲットタンパク質及びそのインタラクター解析ー 20 1~5 ¥77,300 /
¥158,800
6検体以上は要相談
ビオチン化タンパク質の包括的解析(提出サンプル:ビオチンラベル細胞) ーBIo-ID, Trubo-ID細胞サンプル等の精製から対応ー タンパク質:100ug以上
目安: 細胞 1x10^6以上
組織片:2mg以上(組織内容要開示)
25 1~5 ¥99,200 /
¥180,700
6検体以上は要相談
ビオチン化ペプチドの包括的解析 (提出サンプル:ビオチンラベル細胞) ーBIo-ID, Trubo-ID細胞サンプル等の精製から対応ー タンパク質:400ug以上
目安: 細胞 5x10^6以上
組織片:2mg以上(組織内容要開示)
25 1~5 ¥113,700 /
¥195,200
6検体以上は要相談
     
翻訳後修飾を対象としたプロテオーム解析(翻訳後修飾部位の同定と相対定量解析)
メニュー 取得データ目安
ディープ / ウルトラディープ
必要サンプル量 納期 (営業日) サンプル数 カタログ価格(税別)
ディープ / ウルトラディープ
備考
リン酸化 DIAプロテオーム解析 ~15,000 / ~30,000
リン酸化ペプチド
タンパク質:400ug以上
目安: 細胞 5x10^6以上
組織 5mg以上
25 1~5 ¥106,400 /
¥187,900
6検体以上は要相談
リジン-アセチル化 DIAプロテオーム解析 準備中 タンパク質:400ug以上
目安: 細胞 5x10^6以上
組織 5mg以上
25 1~5 ¥128,300 /
¥209,800
6検体以上は要相談
ユビキチン化 DIAプロテオーム解析 準備中 タンパク質:400ug以上
目安: 細胞 5x10^6以上
組織 5mg以上
25 1~5 ¥128,300 /
¥209,800
6検体以上は要相談
     
ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)組織からのタンパク質抽出→プロテオーム解析(*)
メニュー 取得データ目安
ディープ / ウルトラディープ
必要サンプル量 納期 (営業日) サンプル数 カタログ価格(税別)
ディープ / ウルトラディープ
備考
ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)組織からのDIAプロテオーム解析 ~8,000 / ~11,000
タンパク質
ホルマリン固定パラフィン包埋組織
(固定が48時間以下のもの)
厚さ:10~20μm
表面:50mm2以上
25 1~5 ¥91,900 /
¥173,400
6検体以上は要相談
(*)FFPEサンプルからのリン酸化、リジンアセチル化、ユビキチン化プロテオームは対応可
     
培養上清を対象とするプロテオーム解析
メニュー 取得データ目安 必要サンプル量 納期 (営業日) サンプル数 カタログ価格(税別)
ディープ / ウルトラディープ
備考
無タンパク質培地を用いた培養上清からのDIAプロテオーム解析(タンパク質濃縮) 培養上清2mL以上 20 1~5 ¥74,400 /
¥155,900
6検体以上は要相談
FBS含有培養上清からのDIAプロテオーム解析(アルブミン除去) FBS含有培養上清300uL以上 20 1~5 ¥91,900 /
¥173,400
6検体以上は要相談
     
追加オプション解析
メニュー 取得データ目安 必要サンプル量 納期 (営業日) サンプル数 カタログ価格(税別)備考
精製タンパク質の翻訳後修飾解析 PEAKS studio(Astaral測定のみ対応) +5 ¥43,700
サンプル中に含まれる動物種特定(Astaral測定のみ対応) +10 ¥58,300
データ解析(GO解析, Pathway解析, Upstream解析、他) 要相談

納品物

納品形式
HDD、DVD-RまたはUSBメモリスティックに収納して納品

納品ファイル
  • MS測定データ (rawファイル)
  • タンパク質同定・相対定量解析データ(解析ソフトウェアDIA-NNで出力されるデータ)
  • 観測されたタンパク質名(Excelファイル)
  • タンパク質の定量値(Excelファイル)

ご注文に関して

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参考価格・納期

サービス項目 価格(税抜) 納期
DIAプロテオーム解析受託サービス 上記参照ください 上記参照ください

関連サイト