PacBio SequelⅠ& Sequel Ⅱ シーケンシングサービス ID: J01810

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PacBio SequelⅠ/Ⅱを用いたロングリードシーケンスサービスです。

カテゴリ

サービスについて

サービス仕様
・シーケンサー：PacBio SequelⅠ（本サービスはSequelⅠのみ対応）
・納品データ：BAMファイル形式
・納品方法： HDD納品

本サービスは、サンプル種限定の相乗りシーケンスとなります。
別サンプル種等では、対応出来ないサービスとなりますので、ご留意ください。
サンプル要件
ライブラリー調製に使用するKitをご確認の上、下記条件のDNAをご準備ください。
GQNは40 kb以上を基準にしており、2.0の場合は全体の20％以上のDNAが40 kb以上であることを示します。

ライブラリー調製キットサンプルの状態サンプル量 GQN

PacBio Sequel Microbial Library Construction gDNA 4.1µg >2.0
データ解析
・データ解析1（De novo Assemble）
・データ解析2（Gene Prediction/Annotation）
＊データ解析２を実施する場合、データ解析1の実施が必須となります。
デモレポート
De novo Assembly＋Annotationに関して以下をご参照ください。

- 真核生物
PacBio De novo Eukaryote sample report

- 原核生物
PacBio De novo Prokaryote sample report

ライブラリー調製キット	サンプルの状態	サンプル量	GQN
PacBio Sequel Microbial Library Construction	gDNA	4.1µg	>2.0

サービス仕様
・シーケンサー：PacBio SequelⅠ/Sequel Ⅱ
・納品データ：BAMファイル形式
・納品方法： HDD納品

本サービスは、Cellを買い取っていただき、シーケンスを行うサービスとなります。
相乗りシーケンスは対応できません。

【取得データ量について】
以下データ量は、Polymerase Read Bases（シーケンスされたすべてのベース数）での表記となります。
また、サンプルの状態、生物種によっても取得できるデータ量は異なりますので、参考値であることご留意ください。

・SequelⅠの場合：30 Gb前後
・SequelⅡの場合：300 Gb前後

サンプル要件

ライブラリータイプ	ライブラリー調製キット	サンプルの状態	サンプル量	RIN	rRNA ratio
PacBio Sequel Library	PacBio Sequel Iso-Seq Library Construction	Total RNA	0.600µg	7	1
PacBio Sequel Library	PacBio Sequel Iso-Seq Library Construction (+4 kb)	Total RNA	3.000µg	7	1

サービス仕様
・シーケンサー：PacBio SequelⅠ/Sequel Ⅱ
・納品データ：BAMファイル形式
・納品方法： HDD納品

本サービスは、Cellを買い取っていただき、シーケンスを行うサービスとなります。
相乗りシーケンスは対応できません。
＊ DNAサンプルでは、SequelⅡの場合のみCLR Modeと、CCS Mode（HiFi）が選択できます。

【取得データ量について】
以下データ量は、Polymerase Read Bases（シーケンスされたすべてのベース数）での表記となります。
また、サンプルの状態、生物種によっても取得できるデータ量は異なりますので、参考値であることご留意ください。

（SequelⅠの場合）
・WGS実施時：6-9 Gb/sample

（SequelⅡの場合）
・CLR Mode：100 Gb以上　＊最大で150 Gb程度
・CCS Mode：Hi-Fiリード15-25 Gb (Polymerase Read 300 Gb以上)

サンプル要件
ライブラリー調製に使用するKitをご確認の上、下記条件のDNAをご準備ください。
GQNは40 kb以上を基準にしており、2.0の場合は全体の20％以上のDNAが40 kb以上であることを示します。

ライブラリータイプ	ライブラリー調製キット	サンプルの状態	サンプル量	GQN
PacBio SequelⅠLibrary	20 kb SMRTbell Express	gDNA	8.1 µg	>2.0
	10 kb SMRTbell Express	gDNA	8.1 µg	>2.0
	PacBio Amplicon Library Construction (1 kb～5 kb)	Amplicon etc.	1.000 µg
PacBio SequelⅡ Library	20 kb SMRTbell Express	gDNA	8.1 µg	>2.0
	10 kb SMRTbell Express	gDNA	8.1 µg	>2.0
	HiFi (10 kb～25 kb)	gDNA	8.1 µg	>3.0

データ解析
・データ解析1（De novo Assemble）
・データ解析2（Gene Prediction/Annotation）
・データ解析A（Mapping、Variant call）
・データ解析B（SV/CNV）

＊データ解析２を実施する場合、データ解析1の実施が必須となります。
＊データ解析Aは、CCS mode（Hi-Fiリード）のみ対応です。
＊データ解析Bを実施する場合、データ解析Aの実施が必須となります。
デモレポート
De novo Assembly＋Annotationに関して以下をご参照ください。

- 真核生物
PacBio De novo Eukaryote sample report

- 原核生物
PacBio De novo Prokaryote sample report

- illuminaシーケンサーのデータと併せてエラー補正を行う場合（＊）
PacBio Error Correction sample report
＊こちらの解析をご希望の場合は、別途ご相談ください。

お問い合わせフォームよりお問い合わせください。

サービス項目	価格（税抜）	納期
PacBio SequelⅠバクテリア全ゲノムシーケンス（相乗りプラン）	お問い合わせ	解析なし：6週間前後解析あり：解析なしの6週間前後に加えて、以下の解析期間を要します。　　　　　・De novo Assembly：ゲノムサイズに依存します。　　　　　・バクテリアの場合：+1週間程度
PacBio SequelⅠ& Sequel Ⅱ RNAサンプル	お問い合わせ	解析なし：6週間前後解析あり：解析なしの6週間前後に加えて、＋2週間（計8週間前後）
PacBio SequelⅠ& Sequel Ⅱ DNAサンプル	お問い合わせ	解析なし：6週間前後解析あり：解析なしの6週間前後に加えて、以下の解析期間を要します。　　　　　・De novo Assembly：ゲノムサイズに依存します。　　　　　・バクテリア：+1週間程度　　　　　・真核生物（ゲノムサイズがGb単位の場合）：+1～2ヶ月程度　　　　　・SV解析：+1～2週間程度