ダイアジェノード / 日本ジェネティクス ID: J02000

Targeted DNAメチレーション受託解析サービス ID: J02000

サービスについて

サービス仕様

全ゲノム上の既知・特定範囲のメチル化DNAの定量解析手法です。
Targeted DNA methylationによるメチル化解析は、解析したい範囲に応じいくつかの方法で行うことが可能 です。
独自のワークフローを通してお客様のサンプルから高品質の分析データを取得・解析を加え、結果をお手元 にお届けします。
お客様のご注文後、サンプル送付から処理、データ取得、解析を包括的にサポートします。

特長

  • 透明性:お客様とのコミュニケーションを基にカスタマイズされたプロジェクト設計を実施
  • 専門性:専任のデータサイエンティストがプロジェクトの成功をお手伝い
  • アウトプット:包括的なデータ分析結果を出版品質の図表にまとめてご提供
NGS解析、バイオインフォマティクス及びメチローム、RNA-seqを含むマルチオミクスのモデリングにお ける豊富な経験を基にサービスを提供します。

【的を絞ったメチル化解析に】
・部位特異的な DNA メチル化パターンの解析
・1塩基単位の解像度
・高い感度・特異性をトータルのコストでお得に実施
・レアバリアントの解析に極深度シーケンスの実施も可能
・エピゲノムバイオマーカーの確認に最適

Targeted DNA メチレーション解析の流れ

解析したい範囲・対象に応じて異なる分析方法を選べます。

Bisulfite Amplicon Sequencing (BSAS) カスタムキャプチャープローブ
バイサルファイト処理を行ったゲノムDNA上のターゲット領域をPCRで増幅し、得られたアンプリコンからライブラリーを調製して次世代シーケンシングを行います。
アンプリコンを得る過程でPCRプライマー配列と反応条件決定を行います。次世代シーケンスは Illuminaプラットフォームを採用しています。全生物を対象に行えます。
いくつかの CpG 領域を含む長い DNA(~ 200kb)を解析するのに適しています。
断片化したゲノム DNA上のターゲット領域を RNA プローブ(Agilent SureSelect)を用いて配列選択的にキャプチャーします。単離した配列を対象にバイサルファイト処理を行い、次世代シーケンシングで解析します。
次世代シーケンスは Illumina プラットフォームを採用しています。全生物を対象に行えます。
ターゲットとなる CpG 領域を含む長い DNA(200kb~24Mb)を解析するのに適しています。

バイオインフォマティクス

Bisulfite Amplicon Sequencing (BSAS) カスタムキャプチャープローブ
アウトプットファイル
  • シーケンス結果と CpG メチル化統計
  • オリジナル生データを含む FASTQ ファイル
  • FastQC とトリミングレポート
  • BAM フォーマットでのアラインメントデータ
  • アラインメントとメチル化コール
  • bedGraph で解析されたシトシンのメチル化ファイル
  • シーケンス結果と CpG メチル化統計
  • オリジナル生データを含む FASTQファイル
  • FastQC とトリミングレポート
  • BAM フォーマットでのアラインメントデータ
  • アラインメントとメチル化コール
  • bedGraph で解析されたシトシンのメチル化ファイル

オプションでメチル化の示差的解析を行うことも可能ですので、詳細はお問い合わせください。

ご注文に関して

お問い合わせフォーム よりお問い合わせください。

参考価格・納期

サービス項目 価格(税抜) 納期
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