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GxD / GxD ID: J02110

Spatial Transcriptomics ID: J02110

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顕微鏡レベルで細胞の位置情報を持った遺伝子発現解析としてXenium in situ５K 解析、組織の位置情報を持ったNGS解析としてVisium HD解析を提供

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サービスについて

概要

GxD社では10x Genomicsの技術を利用した空間オミックス解析を提供いたします。顕微鏡レベルで細胞の位置情報を持った遺伝子発現解析としてXenium in situ５K 解析、組織の位置情報を持ったNGS解析としてVisium HD解析を提供いたします。（fig.1）（fig.2）

【背景】
従来の「集団的」な遺伝子発現解析では見過ごされがちな細胞間の微細な違いは、位置情報を保持した空間発現解析を用いる事で空間的な配置と細胞単位での発現の違いを高解像度な解析を可能とします。この手法を活用することで、組織内の複雑な細胞間相互作用や疾患における遺伝子発現の異常を明らかにし、医学的な応用が期待されています。

fig.1 Xenium In Situ workflow overview

fig.2 CytAssistを用いたVisiumワークフロー

オプション

オプション解析として、GxD社の空間解析用ソフトウエア（Space Insight）での解析をご利用いただけます。こちらのソフトウエアを利用することで、様々な視点からの解析を行うことが可能となります。また採取した組織全体のeWES解析、WTS解析、WGS解析を提供します。ご相談ください。

検体

GxD社ではFFPEサンプル（切片/ブロック）からの解析を受け付けます。
検体のご準備は【ゲノム診療用病理組織検体取り扱い規定】（日本病理学会）および【がんゲノム検査全般に関する指針】（日本病理学会/日本臨床検査医学会）を参考にしてください。

納品物

  • 作業報告書・Data File （Visium HDではFASTAq VCF BAM）
  • 解析目的に即したSpace Insight解析例（オプション）
  • サンプル全体のNGS解析結果レポート（Fastq VCF BAM）（オプション）

ご注文に関して

お問い合わせフォーム よりお問い合わせください。

製品カタログ・リーフレット
Spatial Transcriptomics

参考価格・納期

サービス項目 Application 価格（税抜） 納期
Spatial Transcriptomics Xenium 5K ￥2,100,000/1Slide～ 6週間（解析目的やオプションの選択によって変わります。）
Xenium Custom Panel ￥2,200,000/1Slide～
SPACEINSIGHTTM ￥150,000/1検体～
Xenium5K ＋SPACEINSIGHTTM ￥2,600,000/1Slide～
Visium HD ￥2,000,000/1Slide～

関連サイト

  • ※価格及び、サービスの仕様・内容などにつきまして、予告なしに変更されることがあります。
  • ※表示している参考価格は消費税等は含まれておりません。
  • ※受託サービスは、すべて研究目的として作業を行います。その他の目的（医療品・食品の製造・品質管理や医療診断など）には使用しないで下さい。
  • ※納期は参考納期です。諸事情により、前後する場合がございます。納期の詳細については個別にお問い合わせください。
  • ※会社名・サービス名などは、各社の商標・登録商標です。
  • ※納品物によっては、その構成物（例えば、ベクター、蛍光色素など）の使用に制限がある場合があります。
  • ※ヒト臨床サンプルの場合はインフォームドコンセントを得ていることをご確認ください。 ヒト由来のサンプルの場合、ご所属の組織の倫理委員会などで承認が得られたものが受領されます。
  • ※人間への感染性が疑われるサンプルに関しては、お受けできない可能性がございます。
  • ※サンプルの保管および返却を行っていない場合があります。お客様より提供いただいたサンプルおよび解析データ等は、業務終了後、廃棄される場合がございます。

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