数百から数万個の細胞遺伝子発現プロファイルを個々の細胞で解析することが可能となります。
| Cell Ranger解析 （本受託サービスに含まれます） |
デマルチプレクス、サマリーメトリクス（シーケンスの品質、検出された細胞数、細胞あたりの平均リード数、細胞あたり検出された遺伝子の中央値など）、ゲノムへのアライメント、遺伝子発現の定量化、発現プロファイルが類似している細胞をグループ化するクラスタリング解析、クラスタ間の発現差解析可視化 |
|---|---|
| 標準解析 （追加解析オプション） |
デマルチプレクス、シーケンスデータの処理と品質管理、ゲノムとのアライメント、細胞のコールとUMIのカウント、品質管理サマリーメトリクス（Cell Ranger / STAR） |
| 高変性遺伝子（HVGs）の同定、細胞サブポピュレーション同定、主成分分析（PCA）、細胞のクラスター同定、次元削減と可視化、マーカー遺伝子検出（クラスター間差分発現解析）（Seurat） | |
| 各種エンリッチメント解析（GO、KEG、パスウェイ、リアクトーム）、転写因子の機能アノテーション、蛋白質間相互作用ネットワーク解析（Cluster Profiler等） |
| サービス項目 | 価格（税抜） | 納期 |
|---|---|---|
| シングルセルシーケンス | お問い合わせ | シングルセル調製後 8週間～ （解析なしの場合） |
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※お問い合わせは完了しておりません。
