概要
中外テクノス株式会社では、次世代シークエンスによる微生物解析受託サービスを提供しています。
環境中に生息する微生物、腸内細菌、皮膚細菌などのDNA塩基配列を網羅的に調べることで、微生物の種類と存在比率を高感度かつ網羅的に解析します。
特長
- 信頼性の高いIllumina社MiSeqによるペアエンドシークエンスを採用。
- 1試料当たり3万リードを保証（5万リードを目安に取得）。
- 真正細菌、古細菌、藻類、真核生物などを網羅的に解析。
- 存在比率0.01～0.1％の微生物が検出可能。
- 解析後も考察・説明など、技術者が丁寧にフォローします。
- 菌叢分類（97％ OTU）
実施内容
お客様は試料（環境、口腔、皮膚、糞便試料）を送付するだけ、中外テクノス株式会社で前処理を実施し、 解析後、菌叢分類リストや菌叢グラフ、解読した全配列を報告致します。（
fig.1）
＊ DNA / RNA抽出が困難な場合は別途費用を頂戴する場合があります。
＊ ヒト試料の場合は匿名化など、個人情報の保護をお願い致します。
報告内容
- 菌叢分類（門、網、目、科、属）リスト（fig.2）
- 分類群（門、網、目、科、属）の菌叢グラフ（fig.3）
- 解読した全配列、代表（OTU）全配列
オプションデータ解析
- 多様性解析（レアファンクション、主座標分析、α多様性、β多様性）（fig.4）
- BLAST解析（fig.5）
- 解析結果の考察、文献調査
例）
・活性汚泥、メタン発酵における運転条件、性能と主要な細菌の役割の関係性。
・バイオフィルム、金属腐食の原因調査。カビ等の発生原因。
分析対象生物
| 対象生物 |
解析遺伝子領域 |
分析例 |
| 原核生物（細菌、古細菌、ラン藻類） |
16S rRNA |
環境、環境技術、ヒトマイクロバイオーム |
| 真核生物（酵母、カビ、藻類） |
18S rRNA, ITS |
環境、生活環境 |
| 魚類（＊1） |
12S rRNA |
環境調査（環境DNA） |
| 哺乳類（＊2） |
12S rRNA |
環境調査（環境DNA） |
| 鳥類（＊3） |
12S rRNA |
環境調査（環境DNA） |
＊1 Miya, et al., doi: 10.1098/rsos.150088;
＊2 Ushio, et al., 2016. doi: 10.1111/1755-0998.12690;
＊3 Ushio, et al., 2018. doi: 10.1038/s41598-018-22817-5.
