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KOTAI バイオテクノロジーズ / KOTAI バイオテクノロジーズ ID: J02045

バルクRNAシーケンス（定量解析付） ID: J02045

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バルク（細胞の塊）RNA-Seqは、サンプル集団の平均的な遺伝子発現を測定します。

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サービスについて

概要

バルク（細胞の塊）RNA-Seqは、サンプル集団の平均的な遺伝子発現を測定します。

【サービス内容】
  • 生物由来の細胞や組織からTotalRNAを抽出する。
  • PolyA構造をキャプチャしてmRNAからcDNAを合成する。
  • cDNAを断片化し、シーケンスアダプターを付加し、ライブラリーを調製する。
  • NGSによるトランスクリプトームの塩基配列情報を読み取る。
  • データをマッピングし、発現遺伝子を定量する。

fig.1 サービスの流れ

特徴

  • 低発現の遺伝子を検出可能
  • 細胞種の共通の特徴の解析に有効
  • 新規及び既知の転写物、融合遺伝子、アリル特異的発現を同定することが可能

解析例

定量解析結果（納品物に含まれます）の例を示します。（fig.2）

fig.2 左図: サンプル間変動遺伝子発現量のヒートマップ。右図: Gene Ontology term Enrichment解析結果。

受託可能なサンプル

必要量 RNA抽出が必要 RNA抽出キット
通常 Total RNA（ポリA鎖を有する種由来） RIN ＞7
Total RNA量＞500ng（但し、20μL以上、10ng/μL以上を満たすもの）
OD A260/280 & A260/230が1.8以上		 - -
細胞 ＞2×106 ✓ RNeasy Mini Kit（QIAGEN）
組織 ＞10mg ✓
微量（＊1） Total RNA（ポリA鎖を有する種由来） RIN ＞7
Total RNA量＜500ng（但し、20μL以上、10ng/μL以上を満たすもの）
OD A260/280 & A260/230が1.8以上		 - -
細胞 1,000（＊1）＜細胞数＜2×106 ✓ RNeasy Micro Kit（QIAGEN）
組織 1mm角（＊1）＜組織量＜10mg ✓
その他 お問い合わせください

＊1 微量サンプルの場合はお問い合わせください。

RNAサンプルは、バイオアナライザ或はTapeStationと分光光度計等により、品質（QC;Quality Control）チェックや濃度測定を行います。高品質なサンプルを調製するため、ご送付いただく組織・細胞等は、できるだけ新鮮なものをご用意ください。

【サンプルの送付方法】
核酸・セルペレットの場合は1.5ｍLのヒンジ付きマイクロチューブ（核酸の吸着が少ないもの）に入れ、油性マジックを用いて、チューブ側面にサンプル名または番号を記入してください。（シールを使用する場合、-80℃以下での使用が可能なサンプルシールを使用し、フタの部分のみに貼り付けてください。シールがはがれるとサンプルの判別が困難になりますので、シールを張る場合も、油性マジックを用いて、チューブ側面にサンプル名または番号を記入してください。）

フリーザーボックス等チューブを保護できるものにいれ、発泡スチロール等に十分な量のドライアイスを同梱したうえ、冷凍便にてKOTAIバイオテクノロジーズ社へ平日（10:00〜17:00）に到着するよう配達日時をご指定の上お送りください。

納品物

  • Fastqデータ
  • 情報シート（RNA抽出が必要な場合）
    解析方法や使用試薬などをまとめたもの
  • 定量解析結果
さらなるデータ解析をご希望の場合はお問い合わせください。

ご注文に関して

お問い合わせフォーム よりお問い合わせください。

参考価格・納期

細胞種や解析内容によっては、上下することもございます。
受託内容 シークエンサー（データ量） 価格（税抜） おおよその納期
国内完結プラン 通常 NovaSeq（3,000万ペアリード） 1サンプル：￥38,000 6週間
微量 1サンプル：￥38,000
海外格安プラン 通常 DNBSeq（2,000万ペアリード） 1サンプル：￥27,500
NovaSeq（2,000万ペアリード） 1サンプル：￥30,000
オプション 価格（税抜）
RNA抽出（RNeasy Mini Kitの場合） 1サンプル：￥6,000
その他 お問い合わせ

＊ 4サンプルからの受注となります。

関連サイト

  • ※価格及び、サービスの仕様・内容などにつきまして、予告なしに変更されることがあります。
  • ※表示している参考価格は消費税等は含まれておりません。
  • ※受託サービスは、すべて研究目的として作業を行います。その他の目的（医療品・食品の製造・品質管理や医療診断など）には使用しないで下さい。
  • ※納期は参考納期です。諸事情により、前後する場合がございます。納期の詳細については個別にお問い合わせください。
  • ※会社名・サービス名などは、各社の商標・登録商標です。
  • ※納品物によっては、その構成物（例えば、ベクター、蛍光色素など）の使用に制限がある場合があります。
  • ※ヒト臨床サンプルの場合はインフォームドコンセントを得ていることをご確認ください。 ヒト由来のサンプルの場合、ご所属の組織の倫理委員会などで承認が得られたものが受領されます。
  • ※人間への感染性が疑われるサンプルに関しては、お受けできない可能性がございます。
  • ※サンプルの保管および返却を行っていない場合があります。お客様より提供いただいたサンプルおよび解析データ等は、業務終了後、廃棄される場合がございます。

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