理研ジェネシス / 理研ジェネシス ID: J02025

シングルセル解析 HIVE CLXTM Single-cell RNAseq Solution ID: J02025

サービスについて

概要

HIVE CLXTM Single-cell RNAseq Solution (Honeycomb biotechnologies社)を用いて1細胞ごとの網羅的3’遺伝子発現プロファイルを取得します。シングルセル化した細胞をHIVETM sample collectorに捕捉し凍結保存するため、凍結融解やマイクロ流路による細胞ダメージを回避することができます。他施設間での検体回収や継時的な検体回収に最適です。

HIVE CLXTMの特徴

  • 特別な機械を必要としない簡単なワークフロー
    少&壊れやすい細胞を重力でピコウェルアレイに緩やかに捕捉
    HIVE CLXTM Single-cell RNAseq Solutionはピコウェル型の独自デバイスHIVETM sample collectorとライブラリー試薬を用いたSingle cell RNA Sequencingのプラットフォームです。マイクロ流路型のような特別な機器は使用せず、重力/遠心によって細胞をHIVETM sample collectorのピコウェルに穏やかに捕捉し、凍結保存が可能です。そのため、顆粒球などの脆弱な細胞も効率よく解析することができます。
  • 細胞を捕捉したHIVE sample collectorは凍結輸送が可能
    HIVETM sample collectorに捕捉した細胞は-20/-80 ℃凍結で最大9ヶ月まで保存ができます。そのため、他施設が参加する研究や継時的な検体採取が必要な研究でご利用いただけます。凍結保存していただいた検体を理研ジェネシス社へ輸送するだけで、シングルセルRNA-Seqが実施できます。(fig.1)(fig.2
  • 一度に数百~数万細胞のシングルセル3’遺伝子発現プロファイルを取得
    HIVETM sample collectorの各ピコウェルには、あらかじめ固有のバーコードとpoly(dT)からなるオリゴヌクレオチドが付加した磁気ビーズが入っています。ピコウェルに捕捉されたシングルセルはLysisされ、細胞由来のmRNAはビーズ上のpoly(dT)に捕捉されます。捕捉されたmRNAをテンプレートに逆転写を行い、mRNAの3’側に対するcDNAを作製します。完成したライブラリーを次世代シーケンサーでリードアウトします。(fig.3
  • * HIVE CLXTM Single-cell RNAseq Solutionに関するは情報はHoneycomb biotechnologies社ホームページでもご確認いただけます。

データ解析(fig.4)(fig.5

Honeycomb Analysis Software BeeNetPlusを用いた遺伝子発現プロファイルのレポートをご提出
  • シーケンスの品質評価
  • シーケンスリードのReference配列へのマッピング
  • 1細胞ごとの遺伝子発現カウントデータの算出
  • クラスタリング解析
  • 細胞種の推定(参考データとなります)

理研ジェネシスのHIVE CLXTM Single-cell RNAseq Solutionは国内自社ラボで完結

ライブラリー作製から解析までを国内自社ラボで実施
理研ジェネシスでは品質保証体制の整った国内自社ラボにて、HIVE CLXTM Single-cell RNAseq Solutionの解析を実施しています。
理研ジェネシス社ラボは医薬品の安全性に関する非臨床試験の実施の基準に関する省令に準じた遺伝子解析試験の実施基準に則っています。さらに、ISO15189認定も取得しており、様々な機関から品質についての認定を受けています。
そのため、医薬品開発においてもHIVE CLXTM Single-cell RNAseq solutionをご提供することが可能です。
理研ジェネシス社の医薬品開発支援についてはこちら→ 理研ジェネシス医薬品開発支援

検体条件・ご提出方法・納品物

  • 検体種
    シングルセル化させたヒト/マウス由来細胞
  • 細胞の数
    30,000細胞/HIVETM sample collector(細胞生存率≧90%推奨)
  • 検体のご提出方法
    検体がローディングされたHIVE sample collectorを冷凍便(ドライアイス梱包)でご送付ください。
    * 検体の詳しい提出方法については、受注時に説明資料をお渡しします。
  • 納品物
    解析報告書、HDD (fastq file, bam file, HTML report, 各種解析file) * HIVE CLXTM

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    参考価格・納期

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