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理研ジェネシス / 理研ジェネシス ID: J02033

ロングリードシーケンスを用いた全トランスクリプトーム解析 ID: J02033

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トランスクリプトーム全体の探索や、個々の遺伝子に焦点を当てた詳細な解析に有用です。

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サービスについて

概要

PacBioのSingle Molecule, Real-Time（SMRT）シーケンシングでは、数万塩基にわたる高精度なロングリード（HiFiリード）を生成できます。このリードは、ほとんどの転写産物を1回のシーケンシングで網羅するのに十分な長さがあります。この技術は、全長アイソフォームのシーケンシングを可能にすることから、トランスクリプトーム全体の探索や、個々の遺伝子に焦点を当てた詳細な解析に有用です。

  1. ゲノムDNAの品質評価
  2. Kinnex full-length RNA Kitを用いたライブラリー調整
  3. PacBio社Revioを用いたシーケンシング

特長

  • Kinnex full-length RNA Kit（ライブラリー調整試薬） とPacBio社Revio（シーケンス装置）を用いた全長ロングリードシーケンスを実施。
  • 新規融合遺伝子の探索に有用。
  • 長鎖ノンコーディングRNAの同定が可能。

納品物

  • 解析報告書
  • データHDD：hifi_reads.bam/pbi、hifi_reads.fastq、hifi_reads.fastaおよびxmlを含むRaw data
＊ ロングリードシーケンスのデータ解析をご希望の場合は、別途ご相談ください。

サンプル条件

サンプル Total RNA（＊）
RNA量 0.3µg 以上
RIN値 7 以上
溶媒 DTA、2価の金属陽イオン、変性剤、界面活性剤を含まないバッファー

＊ 推奨キットや核酸抽出サービスに関しては、お問い合わせください。
＊ 4検体単位でのご提出となります。

ご注文に関して

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参考価格・納期

サービス項目 価格（税抜） 納期
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  • ※価格及び、サービスの仕様・内容などにつきまして、予告なしに変更されることがあります。
  • ※表示している参考価格は消費税等は含まれておりません。
  • ※受託サービスは、すべて研究目的として作業を行います。その他の目的（医療品・食品の製造・品質管理や医療診断など）には使用しないで下さい。
  • ※納期は参考納期です。諸事情により、前後する場合がございます。納期の詳細については個別にお問い合わせください。
  • ※会社名・サービス名などは、各社の商標・登録商標です。
  • ※納品物によっては、その構成物（例えば、ベクター、蛍光色素など）の使用に制限がある場合があります。
  • ※ヒト臨床サンプルの場合はインフォームドコンセントを得ていることをご確認ください。 ヒト由来のサンプルの場合、ご所属の組織の倫理委員会などで承認が得られたものが受領されます。
  • ※人間への感染性が疑われるサンプルに関しては、お受けできない可能性がございます。
  • ※サンプルの保管および返却を行っていない場合があります。お客様より提供いただいたサンプルおよび解析データ等は、業務終了後、廃棄される場合がございます。

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