サービス仕様
- シーケンシング：illumina Novaseq X Plus
- 納品データ：fastqファイル形式
＊ Read1とRead2それぞれ作成されますので、1サンプルにつき2つのファイルを納品いたします。
- 使用できるライブラリー調製キット
・TruSeq Nano DNA High Throughput Library Prep Kit
・TruSeq DNA PCR Free Kit
- 取得合計データ量が100 G base 未満の場合は、基本はクラウド納品となります。
取得合計データ量が110 G base 以上になった場合は、HDDでの納品となります。
なお1サンプルのデータ量が90 G base 以上を超えた場合は、合計データ量とは関係なくHDDでの納品となります。
PCR-freeのメリットとデメリットについて
- PCR-freeのメリット
・PCRエラーやバイアスを無視できます。
・Duplication Rateが低く、ターゲット領域で、均一なカバレッジが得られることが期待できます。
- PCR-freeのデメリット
・お送りいただくDNA量が多く必要となります。
対して、PCRありの場合は、PCRエラーの影響を受ける可能性がありますが、PCR-freeよりも、少量のサンプル量からご依頼いただくことが可能です。詳細については、サンプル要件をご確認ください。
対応できる解析メニュー
WGS Non-Human SNP Analysis
