マイクロアレイ～コピー数変異（CNV）～ ID: J00720

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ヒト全染色体レベルのコピー数変異解析用途としてGeneChip HD Arrayによるマイクロアレイ解析のサービスをご提案いたします。

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サービスについて

ISCA、Cancer Gene、X Chromosome、OMIMなどのデータベースからデザインされた260万以上のCopy Numberプローブで構成されており幅広いご研究でご使用いただけます
解析ソフトウェア（ChAS：Chromosome Analysis Suite）を用いてビジュアル化した解析画像データの取得が可能です（fig.1）
高解像度（平均マーカー間隔880bp）な遺伝子コピー数以上を検出できます
メーカー提供referenceデータ（＊1）との比較を行うため、referenceサンプルのご提供が不要です
＊1 referenceデータ（多人種または日本人のみ）は目的に合わせてご選択いただけます
SNPマーカーもデザインされているためLOHの検出も可能です
Positive Controlを同時アッセイすることでFFPE由来サンプルの解析も可能（＊2）です
＊2 クオリティチェックの結果、DNAの分解が基準を満たす場合に限ります

【このようなお客様にお勧めします】

遺伝子発現	対応生物種 / マーカー数		特徴
CytoScan HD	ヒト	2,600,000以上	・高解像度（平均マーカー間隔880bp）な遺伝子コピー数異常検出・メーカー提供referenceデータとの比較を行うため、referenceサンプルの提供不要・referenceデータ（多人種or日本人のみ）は目的に合わせて選択可能・SNPマーカーもデザインされているためLOHの検出も可能
CytoScan 750K	ヒト	750,000以上	・CytoScan HDから主要プローブ抜粋したアレイ設計・低価格

コピー数マーカーの総数	2,696,550
・非多型マーカーの数	1,953,246
・SNPマーカーの数	743,304
遺伝子型を同定可能なSNPマーカーの総数	749,157
ゲノムビルド	hg19
常染色体マーカー	2,491,915
偽常染色体マーカー	4,624
遺伝子内マーカー	1,410,535
遺伝子間マーカー	1,286,015
マーカー間隔の平均（塩基対）
・遺伝子内　（以下のすべての遺伝子内）	880
ISCA consitutional genes	384
Cancer genes	553
OMIM Morbid genes	659
X chromosome OMIM Morbid genes	486
RefSeq genes	880
・遺伝子間　（非遺伝子バックボーン）	1,737
・全体　（遺伝子および非遺伝子バックボーン）	1,148
遺伝子カバー率（25マーカー/100kb）
ISCA constitutional genes (340)	100%
Cancer genes (526)	100%
OMIM Morbid genes (2,640)	98%
X chromosome OMIM Morbid genes (177)	100%
RefSeq Genes (36,121)	96%

＊上記基準に満たない場合、その他サンプル性状の場合はお問い合わせください
＊サンプル準備～ご発送手順ページもご覧ください

以下のファイルをご利用の上、お問い合わせフォームからご送付ください。

専用注文書類

サービス項目	価格（税抜）	納期
マイクロアレイ～コピー数変異（CNV）～	お問い合わせ	アレイ調達：1～3週間解析：15営業日～