サンプル内にどのような種類の細菌がどれだけいるのかについて、次世代シークエンサーを用いた手法により解析します。
| 1 | DNA抽出/サンプルのクオリティチェック（QC） DNA抽出およびサンプルのクオリティチェック（QC）を行います。 |
|---|---|
| 2 | PCR増幅、定量 PCRベースのプロトコールに従って増幅します。 |
| 3 | シーケンス MiSeqによるシーケンス解析を行います。 |
| 4 | データ解析（オプション） データベースによる相同性検索、検体の菌叢を構成する帰属分類群の推定を行います。 |
| 1 | プライマー配列の除去、ペアエンド配列アセンブル |
|---|---|
| 2 | データベースによる相同性検索、検体の菌叢を構成する帰属分類群の推定 |
| 3 | オプション解析 α多様性解析および統計解析 β多様性解析および統計解析 ヒートマップ・クラスター分析 |
| 4 | 最終結果レポートの作成 |
| 検体の種類 | 必要量 | 送付方法・その他 | |
|---|---|---|---|
| 糞便、腸内容物 | 採便容器（保存液なし） | 0.2～0.5g | 冷凍保存 |
| 採便容器（保存液あり） | 冷蔵保存 | ||
| 唾液 | スワブ | 0.2～1mL | 冷凍保存 |
| 皮膚拭取物 | お問い合わせ | 綿棒などで広範囲を拭い、 少量のPBSなどに移し冷蔵保存 |
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| FFPE由来組織 | お問い合わせ | 冷蔵輸送 | |
| DNA抽出物 | 200ng以上 | 冷凍または冷蔵輸送 分解が進んでいるサンプルは 解析できない場合があります。 |
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・サンプル量が上記に満たない場合はお気軽にご相談ください。
・抽出時に使用している有機溶媒が混入していないDNAをご送付ください。
・FFPEスライド等は、DNA / RNA抽出をご確認いただくか別途お問い合わせください。
・送付方法はサンプル送付方法をご確認ください。
| サービス項目 | 価格（税抜） | 納期 |
|---|---|---|
| 16S rRNA解析（細菌叢解析） | お問い合わせ | サンプルQC通過後、約2ヶ月 （データ解析を含む場合は約2.5ヶ月） |
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※お問い合わせは完了しておりません。
