概要
PEPperPRINT社の包括的なペプチドマイクロアレイを使用した受託解析サービスです。
抗体のエピトープ解析や、自己免疫 / がん研究、抗体医薬品の研究開発など、様々な用途に利用することができます。
本解析に使用するアレイは、独自の合成技術を採用しており、膨大な数のペプチドをアレイ上に直接プリントしています。アレイには、ご要望に合わせてカスタム作製するものや、研究目的に合わせてご選択いただけるレディーメイドのものなど、様々なマイクロアレイをご用意しており、アレイ解析の高度な専門知識や、スキャナー等の解析装置が無くとも、ペプチドアレイ解析をスムーズに実施することができます。
特長
- 独自のOn-Chip合成技術（PEPperCHIP® Platform Technology）で作製したマイクロアレイを使用したサービス
- ハイスループットスクリーニング
- アレイレイアウトやサブアレイ数、搭載ペプチドのデザインなどのカスタマイズが可能
- コントロールペプチドとしてHA（YPYDVPDYAG）およびFlag（DYKDDDDKAS）を採用
- カスタムガラスコーティングによる優れたS/N比を実現
サービス内容
本サービスでは、お客様の解析したい抗体、タンパク質などに合わせてカスタムでマイクロアレイを作製し、ご提供いただいたサンプルで解析まですべて実施いたします。（PEPperPRINT社で販売されているマイクロアレイを使用した解析にも対応しています。）
【アレイの種類】
本サービスでは、スタンダードとディスカバリーの2種類のアレイフォーマットをご用意しています。ディスカバリーフォーマットは、サービスのみのご提供となりますが、スタンダードフォーマットはスライド単体での販売も行っています。
［スタンダードフォーマット］
・
PEPperCHIP® Custom Peptide Microarrays：最大5,500ペプチドをデュプリケートで搭載可能なカスタムアレイ
・
PEPperCHIP® Standard Peptide Microarrays：感染症やがん、自己免疫研究用にデザインされたマイクロアレイ。
［ディスカバリーフォーマット］
・PEPperCHIP
® Discovery peptide Microarray：最大35,000のペプチドをデュプリケートで搭載可能な大規模解析用のカスタムアレイ。
サービスワークフロー
- カスタムペプチドアレイの作製
タンパク質のアミノ酸配列情報またはペプチドコレクション情報に基づき、カスタムペプチドマイクロアレイの製造を行います。
- マイクロアレイのハイブリダイゼーション
ご提供頂いた抗体、血清 / 血漿、あるいは精製標的タンパク質サンプルと、その二次抗体によるイムノアッセイ、抗Flag抗体および抗HA抗体を用いたコントロールアッセイなどを行います。
- ペプチドアレイのスキャンニングおよびデータ読み取り
マイクロアレイスキャナーを用いて、ハイブリダイゼーション後のマイクロアレイを読み取ります。
- データの定量化および評価
専用解析ソフトウェア PeptideSlide® Analyzerを用いて、スキャン画像に基づくデータ定量化、データ評価、最終レポートを作成します。
解析アプリケーション
サンプル条件
各アプリケーションで解析に必要なサンプル条件が異なります。詳しくはお問合せください。
プロジェクト目的（アプリケーション）や抗原の配列長、生物種（ヒト、マウス）、サンプルタイプ（血清、モノクローナル抗体など）、解析サンプル数などをご連絡ください。
サンプルが血清などの場合は、解析目的の抗体クラス（IgG、IgM、IgE、IgAなど）をご連絡ください。
サンプルが抗体の場合は、二次抗体を使用した検出系を利用するため、抗体のホスト（マウス、ラットなど）およびアイソタイプ（IgGなど）をお知らせください。モノクローナル抗体の場合は、ウェスタンブロット測定（変性条件下）での、目的のバンド検出の有無をご連絡ください。
以下の条件は解析の目安です。使用するアレイのフォーマットや抗体のクラス、合成ペプチドの種類によって必要量が異なる場合があります。
| アプリケーション |
条件 |
| リニアエピトープマッピング |
・抗原タンパク質のアミノ酸配列情報
・20μL以上の血清または20μL以上の精製抗体 |
| 立体配座エピトープマッピング |
・抗原タンパク質のアミノ酸配列情報
・N-C末端還化方法に指定がある場合はその情報
・20μL以上の血清または20μg以上の精製抗体 |
| エピトープ置換スキャン |
・単一または二重置換スキャンの開始エピトープおよびペプチド配列情報
・単一置換の場合は、20μL以上の血清または20μg以上の精製抗体
・二重置換の場合は、100μL以上の血清または100μg以上の精製抗体 |
| 抗原とエピトープの同時探索 |
・ランダムペプチド、カスタムぺプチドライブラリー、またはオーバーラップペプチドなどの抗原配列情報
・スタンダードフォーマットの場合は、20μL以上の血清または20μg以上の精製抗体
・ディスカバリーフォーマットの場合は、100μL以上の血清または100μg以上の精製抗体 |
| 免疫モニタリング |
・抗原タンパク質のアミノ酸配列情報 |
| 血清バイオマーカー探索 |
・抗原タンパク質のアミノ酸配列情報、またはペプチドライブラリー情報
・スタンダードフォーマットの場合は、20μL以上の血清または20μg以上の精製抗体
・ディスカバリーフォーマットの場合は、100μL以上の血清または100μg以上の精製抗体 |
| ペプチドターゲットバインダー開発 |
・ランダムペプチド、または事前に選択されたペプチドライブラリー情報
・100μg以上の精製標的タンパク質（ビオチン、Flag、HisまたはHAなどのタグ付きのもの） |
| ネオエピトープ解析 |
・抗原タンパク質の遺伝子情報
・サンプル量については、お問合せください。 |
納品データ
下記の納品物をCD/DVD形式に収録してご報告いたします。
ご選択頂いたアプリケーションによって、データの形式が変更される場合があります。
・プロトコール、実験内容、実験結果を含む最終レポート（PowerPoint形式）
・ペプチドアレイ解析データ（Excel形式）
