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ユーロフィンジェノミクス / ユーロフィンジェノミクス ID: J00472

次世代シーケンス ゲノム解析 ID: J00472

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ゲノム情報が利用可能な生物種の変異・バリアントの探索を目的とした、ゲノムリシーケンシング解析を行います。

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サービスについて

特長

ゲノム解析［ゲノム解析　NovaSeqバリュープライス］

ゲノム情報が利用可能な生物種の変異・バリアントの探索を目的とした、ゲノムリシーケンシング解析を行います。 ゲノム情報が利用できない生物種でも、バイオインフォマティクス解析なしのゲノムシーケンスまでは行います。

  • 標準全ゲノム解析：インサートサイズ350bp
  • バイオインフォマティクス解析：参照ゲノム配列へのマッピング、変異候補探索、変異候補部位のアノテ ーション付与

サービス内容

  1. 受領したDNAサンプルについて、品質確認（サンプルQC）を行います。
  2. DNAを断片化後、サイズセレクションを行います（＊1）
  3. 断片化したDNAにアダプターを付加し、ゲノムショットガンライブラリーを調製します。
  4. 調製したライブラリーをシーケンシングします。
  5. （オプション解析）参照ゲノムにマッピングした後、変異箇所の抽出などの解析が可能です。
＊1 DNAの断片化及びサイズセレクション
・ゲノムショットガンライブラリ調製：350bpインサート（fig.1）

ゲノムDNAをサンプルとしてお預かりして調製する、標準のゲノムショットガンライブラリとなります。物理的切断によりゲノムDNAを約350bpの大きさに切断し、所定のアダプタを付加することにより、ゲノムショットガンライブラリを調製します。NovaSeq X 2x150bp解析では、インサート長平均350bpのゲノムインサートの両端150bpをシーケンシングします。

fig.1 インサート長

サンプル条件

DNAサンプルのご準備に際しての注意事項は以下の通りです。

  • 標準全ゲノム解析：高品質のゲノムDNAを2μg以上（濃度は20ng / μL以上）ご調製ください。
  • カスタムゲノムショットガン：高品質のゲノムDNAを5μg以上（濃度は20ng / μL以上）ご調製ください。
  • 核酸定量は、蛍光測定法をお勧めします。サンプル量が規定量に満たない場合はご相談ください。
  • DNAサンプルはTEもしくは、市販DNA抽出キット付属の溶出液に溶解してください。
  • 電気泳動にてサンプルに分解がないことをご確認ください。
    ＊ 品質が良くない場合は、特別な処理が必要になり、追加料金を頂戴することもございます。
  • RNAのコンタミネーションがないことを確認してください（RNase処理を推奨）。
  • 冷蔵もしくは冷凍便にて送付してください。

納品物

DNA-Seq データのマッピング＆変異解析

［解析なしの場合］
  • シーケンシング配列データ（Rawデータ）：FASTQ形式
［解析ありの場合］
  • シーケンシング配列データ（クリーニング後）：FASTQ形式
  • マッピング結果データ：bam形式
  • 変異解析結果データ：vcf形式（fig.2）をご覧ください

fig.2 DNA-Seq データのマッピング＆変異解析

ご注文に関して

お問い合わせフォーム よりお問い合わせください。

参考価格・納期

ゲノム解析
  • サンプルQC、ライブラリ調製、出荷費用を含みます
  • Hiseq X 2×150bp、10Gb/total～、20Gb/total～、40Gb/total～、80Gb/total～、1レーン
  • 納期：サンプルQC合格後4～7週
    ＊ バイオインフォマティクス解析ありの場合、＋1~2週

【相乗り参考価格】
<10Gb/total～の場合>
項目 合計（税抜） 1サンプルあたり
価格（税抜） データ量
1サンプルバリュープライス ￥62,400 ￥62,400 10Gb / sample～
＜変異候補抽出解析　+￥48,000/sample＞
2サンプルバリュープライス ￥84,000 ￥42,000 平均5Gb / sample～
＜変異候補抽出解析　+￥48,000 / sample＞
10サンプルバリュープライス ￥256,800 ￥25,680 平均1Gb / sample～
＜変異候補抽出解析　+￥36,000 / sample＞

10Gb / total 以外のデータ量も承っております。お問い合わせください。

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  • ※価格及び、サービスの仕様・内容などにつきまして、予告なしに変更されることがあります。
  • ※表示している参考価格は消費税等は含まれておりません。
  • ※受託サービスは、すべて研究目的として作業を行います。その他の目的（医療品・食品の製造・品質管理や医療診断など）には使用しないで下さい。
  • ※納期は参考納期です。諸事情により、前後する場合がございます。納期の詳細については個別にお問い合わせください。
  • ※会社名・サービス名などは、各社の商標・登録商標です。
  • ※納品物によっては、その構成物（例えば、ベクター、蛍光色素など）の使用に制限がある場合があります。
  • ※ヒト臨床サンプルの場合はインフォームドコンセントを得ていることをご確認ください。 ヒト由来のサンプルの場合、ご所属の組織の倫理委員会などで承認が得られたものが受領されます。
  • ※人間への感染性が疑われるサンプルに関しては、お受けできない可能性がございます。
  • ※サンプルの保管および返却を行っていない場合があります。お客様より提供いただいたサンプルおよび解析データ等は、業務終了後、廃棄される場合がございます。

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