次世代シーケンサーを用いたメチル化シトシンシーケンス
| 全ゲノムメチル化シーケンス解析 | RRBS解析（Reduced Representation Bisulfite Sequencing） | |
|---|---|---|
| 特長 | ・全ゲノムにおいてシトシンサイトのメチル化率を1塩基レベルで定量解析。高い網羅性。 ・CpG以外のCHGやCHHサイトも解析可能 |
・ゲノムワイドに1塩基レベルでメチル化率を算出 ・CpGサイト近傍を制限酵素で切断し、バイサルファイト処理後、その切り口をシーケンス解析 ・ヒトの場合で400万ヶ所以上、マウスで200～400万ヶ所程度のCpGサイトのメチル化率を定量解析 |
| 網羅性 | ||
| コスト |
＊ 全ゲノムメチル化シーケンス解析の情報解析作業は（株）Rhelixaで実施します。
＊ RRBS解析はActive Motif社で実施します。
| 解析方法 | DNA量 | 濃度 | 純度 | ||
|---|---|---|---|---|---|
| OD260/OD280 | OD260/OD230 | ||||
| ゲノムDNA | 全ゲノムメチル化シーケンス解析 | 600ng以上 | 10ng/μL以上 | 1.6以上 | |
| RRBS解析 | 100ng以上 | 10ng/μL以上 | |||
| 組織・細胞（オプション） | お問い合わせ | ||||
・上記基準はヒトゲノムを解析する場合の値です。ゲノムサイズにより必要量が異なりますので別途お問い合わせください。
・DNAは滅菌水もしくはReduced EDTA TE buffer：10mM Tris-HCl、0.1mM EDTA pH8.0に溶解してください。
・電気泳動（1％ゲル）にて10～20kbに明確なバンドが検出され、低分子の混入及び分解がないことをご確認ください。
【サンプル送付容器について】
・ゲノムDNAサンプルは1.5mLチューブでご送付ください。0.2 ml、0.5 ml、8連チューブでのご提供はご遠慮ください。
24検体以上の場合は、96 well plateでご送付ください。プレートで送付いただけない場合は、納期が延びる場合がございます。
＜推奨プレートおよびシール＞
・Eppendorf twin.tec full-skirted 96-well PCR plates(Eppendorf社, No. EP-0030128.648)
・タイタースティックHCフィルム（WATSON社, No. 547-KTS-HC）
お問い合わせフォーム よりお問い合わせください。
| サービス項目 | 価格（税抜） | 納期 |
|---|---|---|
| DNAメチル化解析（NGS） | お問い合わせ | お問い合わせ |
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