サービス仕様
- シーケンシング：illumina NovaSeq X Plus / DNBSEQ T7
- 納品データ：fastqファイル形式
- 納品方法：データダウンロード（100Gb未満）/HDD納品（100Gb以上）
ライブラリー調製方法
mRNAをキャプチャー後に、NEBNext Ultra RNA LP Kitでライブラリーを調製します。
データ解析（オプション）
標準データ解析（リファレンスあり）
定量データ解析（リファレンスあり）
定量データ解析（リファレンスなし/De novo）
クリーンデータ
クリーンデータ（CatNo. NV-CLEAN）をご依頼いただくと、以下の作業を行います。
1）オーバラップやアダプターダイマー等により、読み取ったアダプター配列の除去。
2）低質リード（Qphred ≦ 5の塩基数が全体リードの50%以上を占めるリード）の除去。
＊ Qphred=-10log10(e)塩基配列識別の正確性を示す単位。
3）塩基配列不明(N)が10％を超えるリードの除去。
＊クリーンデータ後のデータは、fastqファイル形式となります。
＊クリーンデータ前後のデータ両方を納品させていただきます。
