カテゴリー
関連サイト
お問い合わせ
詳細検索
タカラバイオ / タカラバイオ ID: J00106

ショットガンメタゲノム解析 ID: J00106

印刷

微生物群のゲノム / 遺伝子情報を網羅的に解析

カテゴリ

サービスについて

特長

  • 次世代シーケンサーを用いたメタゲノムのショットガンシーケンス
  • 菌種組成および菌叢の持つ機能を解明
  • 糞便等様々なサンプルからのDNA抽出にも対応可能

サービス内容

メタゲノムDNAからショットガンライブラリーを作製後、イルミナシーケンサーを用いてシーケンスデータを取得します。取得したリードについて、データベース配列へマッピングすることで、菌種組成、また同時にアセンブルにより菌叢の持つ代謝機能を明らかにします。BacteriaだけでなくArchaea、Viruses（二本鎖DNAウイルス）、fungi、Microbial eukaryotes（藻類やプロトゾア）も解析対象に含まれます。

納品物

  • 作業報告書
  • シーケンスデータ一式
  • 系統分類・機能解析結果一式

受入サンプル

  • 生体サンプル等

    サンプル量 温度
    糞便 目安：200mg程度（小豆大）程度（＊） 冷凍

    ＊ 採取・送付方法について事前にお問い合わせください。

  • ゲノムDNA
    以下の点にご注意の上、解析サンプルを調製してください。
    サンプル量 濃度 液量（目安） 純度
    OD260/OD280 OD260/OD230
    ゲノムDNA 200ng以上 5ng/μL以上 40μL以上 1.6以上

    ・上記基準に満たない場合や土壌などの環境サンプルの場合は、別途お問い合わせください。
    ・DNAは滅菌水もしくはReduced EDTA TE buffer：10mM Tris-HCl、0.1mM EDTA pH8.0に溶解してください。
    ・電気泳動（1％ゲル）にて10～20kbに明確なバンドが検出され、低分子の混入及び分解がないことをご確認ください。


【サンプル送付容器について】
・ゲノムDNAサンプルは、1.5mLチューブでご提供ください。0.5 mlチューブ、PCRチューブ、8連チューブでの提供はご遠慮ください。
　24検体以上の場合は96 well plateでご提供ください。プレートで送付いただけない場合は、納期が延びる場合がございます。

＜推奨プレートおよびシール＞
・Eppendorf twin.tec full-skirted 96-well PCR plates(Eppendorf社, No. EP-0030128.648)
・タイタースティックHCフィルム（WATSON社, No. 547-KTS-HC）

ご注文に関して

お問い合わせフォーム よりお問い合わせください。

参考価格・納期

サービス項目 価格（税抜） 納期
ショットガンメタゲノム解析 お問い合わせ お問い合わせ

関連サイト

  • ※価格及び、サービスの仕様・内容などにつきまして、予告なしに変更されることがあります。
  • ※表示している参考価格は消費税等は含まれておりません。
  • ※受託サービスは、すべて研究目的として作業を行います。その他の目的（医療品・食品の製造・品質管理や医療診断など）には使用しないで下さい。
  • ※納期は参考納期です。諸事情により、前後する場合がございます。納期の詳細については個別にお問い合わせください。
  • ※会社名・サービス名などは、各社の商標・登録商標です。
  • ※納品物によっては、その構成物（例えば、ベクター、蛍光色素など）の使用に制限がある場合があります。
  • ※ヒト臨床サンプルの場合はインフォームドコンセントを得ていることをご確認ください。 ヒト由来のサンプルの場合、ご所属の組織の倫理委員会などで承認が得られたものが受領されます。
  • ※人間への感染性が疑われるサンプルに関しては、お受けできない可能性がございます。
  • ※サンプルの保管および返却を行っていない場合があります。お客様より提供いただいたサンプルおよび解析データ等は、業務終了後、廃棄される場合がございます。

/

お問い合わせリストへ

※お問い合わせは完了しておりません。